Per quanto riguarda gli aspetti naturalistici ed ecologici del territorio si possono fare alcuni considerazioni. Secondo la classificazione adottata per l’Italia meridionale si fa riferimento a piani altimetrici nei quali si riconoscono orizzonti comprendenti varie formazioni vegetazionali delimitate essenzialmente dalla temperatura che diminuisce salendo in altezza sul mare.
Il territorio di Polignano a Mare è caratterizzato, nelle residue aree boscate, da lembi di querceti in cui sono presenti fragno, Quercus Troiana e Macedonia, frequenti sono pure il leccio, Quercus Ilex e la roverella (Quercus Pubescens).
Si segnala che la flora presente in questo territorio è unica e rappresenta la formazione vegetale fra le più interessanti qui in Puglia.
Le aree boscate ricoprono solo una porzione del territorio comunale, la rimanente parte, non edificata, è destinata ad uso coltivazione, in particolare molto sviluppata è la coltura dell’olivo, del mandorlo, del ciliegio e della vite.
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